Στην ΕΠΟ δεν στέκονται μόνο στο θέμα του Κυπέλλου. Θεωρούν μεταξύ άλλων πως η Επιτροπή Επιτροπή Επαγγελματικού αθλητισμού κάνει παρεμβάσεις σε ζητήματα της Ομοσπονδίας και προξενεί προβλήματα.

Για τον λόγο αυτό σύμφωνα με πληροφορίες του Gazzetta.gr επρόκειτο να σταλεί την Τρίτη επιστολή από την ελληνική Ομοσπονδία προς τον Σταύρο Κοντονή για την παραμέτρο αυτή. Στην ΕΠΟ θεωρούν πως πρόκειται για ένα ακόμα κομμάτι που συνιστά παραβατικότητα και επεμβαίνει στην αυτονομία και το αυτοδιοίκητό της. Και για το εν λόγω ζήτημα είναι ενήμερη και η FIFA και η UEFA.